Σε δεξαμενή αποβλήτων μετατρέπεται ο Αλφειός, σύμφωνα με έρευνα επιστημόνων του πανεπιστήμιου Πατρών. Σε τμήματα του ποταμού σε Αρκαδία και Ηλεία, διαπίστωσαν ότι υπάρχουν υψηλές συγκεντρώσεις επικίνδυνων τοξικών αποβλήτων, βαρέων μετάλλων και ενώσεων θείου.

Οι επιστήμονες αναφέρουν ότι η μεγάλη πηγή ρύπανσης του ποταμού είναι η καύση του λιγνίτη που γίνεται στη Μεγαλόπολη αλλά και η τέφρα από την επεξεργασία.

Στην Ηλεία οι πηγές ρύπανσης του Αλφειού είναι τα ελαιουργεία και τα αστικά απόβλητα. Oι κάτοικοι της Πελλοποννήσου ζητούν επίμονα την άμεση επέμβαση της πολιτείας και των τοπικών αρχών για να βρεθεί λύση σε αυτό το περιβαλλοντικό ζήτημα.